模型

微软公开单细胞基础模型检查点集合,提供375个神经网络权重与加载工具

scFM-dataselection pretraining checkpoints

模型训练模型评测预训练基准与评测资源

概述

scFM-dataselection集合对应已发表的单细胞基础模型预训练数据研究,提供Geneformer、scVI与SSL/MLP各125个检查点,以及80组PCA矩阵,总下载量约22.4GB。模型覆盖随机抽样、细胞类型重加权和几何草图等方案,以及不同预训练数据比例,便于复用零样本和微调比较。模型卡给出Python 3.10、CPU加载示例和独立模型选择方法;使用自有数据时仍须匹配基因顺序、归一化及各架构输入格式。权重、PCA和加载代码采用MIT许可,部分分词资源采用Apache 2.0。本次计入可移植模型资源的公开交付,原论文与代码研究时间早于本日,不重复作为论文发布。