技术实践

Biofy 用 NVIDIA 加速计算与 AI 做传染病诊断与抗生素耐药预测

应用与实践科学研究

概述

背景与问题:巴西公司 Biofy 专注AI驱动的传染病诊断。此前医院依赖培养与药敏试验,约5天才能确定病原体与耐药谱,期间医生常先用广谱抗生素,推高成本并加剧耐药;多数医院缺乏基因组与AI能力,难以把测序数据快速变成床旁决策。方案与落地:Biofy 在 Oracle Cloud Infrastructure 上搭建云原生管线,用NVIDIA加速算法组装细菌全基因组、向量化后与数十万级微生物基因组及耐药标记库比对,再由推荐引擎 Abby 分析耐药基因、给出抗生素建议并直接进入临床工作流。技术栈含 RAPIDS(cuDF/cuML)做DNA矩阵运算与纠错、32块H100 GPU 训练与推理;基于 Llama 3 架构的模型持续生成超10万条合成DNA序列以预判新耐药变异。效果与数据:据介绍,从测序到治疗建议由5天缩至约4小时(提速30倍),性能提升50%、成本约为其他云厂商一半,诊断准确率达95-97%,而传统PCR+药敏组合约80%、失败率33%;官方称商业上线以来完成数千例检测、拯救超百人,并有一例腿部重症感染患者数小时内确诊、保住腿。公司正进军美国市场,计划两年内推出抗菌肽基础模型。