论文

Mozi:面向药物发现 LLM 智能体的受治理自主

Mozi: Governed Autonomy for Drug Discovery LLM Agents

智能体系统Agent 动作执行与治理Agent Harness

摘要

工具增强的大语言模型(LLM)智能体有望统一科学推理与计算,但其在药物发现等高风险领域的部署受两个关键瓶颈制约:工具使用治理不受约束和长程可靠性差。在依赖密集的制药流水线中,自主智能体常漂移到不可复现的轨迹,早期幻觉以乘法方式累积成下游失败。为克服这一点,我们提出 Mozi,一个桥接生成式 AI 灵活性与计算生物学确定性严谨的双层架构。A 层(控制平面)建立受治理的监督者-工作者层级,强制基于角色的工具隔离、把执行限制在受约束动作空间,并驱动基于反思的重规划。B 层(工作流平面)把经典药物发现阶段——从靶点识别到先导优化——操作化为有状态、可组合的技能图。该层整合严格数据契约与策略性人机协同(HITL)检查点,在高不确定性决策边界保障科学有效性。秉持“安全任务自由推理、长程流水线结构化执行”的设计原则,Mozi 提供内建稳健机制与轨迹级可审计性,以完全消除误差累积。我们在精选生物医学智能体基准 PharmaBench 上评估 Mozi,展现优于既有基线的编排准确率。此外,通过端到端治疗案例研究,我们展示 Mozi 遍历大规模化学空间、执行严格毒性过滤并产出高竞争力计算候选分子的能力,把 LLM 从脆弱的对话者切实转变为可靠、受治理的联合科学家。

Mozi:面向药物发现 LLM 智能体的受治理自主
图1:Mozi的系统架构 (a) 智能体层级结构,设有一个中央Coordinator,管理专门的Research与Computation子worker。(b) 执行流水线依次经历任务定义、动态子智能体实例化、带重规划的反思驱动监控,以及结构化报告合成。(c) 关键设计原则包括分层工具访问、严格的监督者–子worker控制,以及与多粒度科学工作流的对齐。(d) 规范的发现生命周期需要覆盖集成的计算流水线、生物医学数据库与实时网络检索工具。(e) MCP平台作为基础集成层,将复杂的计算生物学工具抽象为自主智能体与人类专家均可访问的标准化接口。