TSAssistant：用于自动目标安全评估的人在环代理框架

靶点安全评估（TSA）需要系统地整合遗传、转录组、靶点同源性、药理学和临床数据，以评估治疗靶点的潜在安全性。这个过程是劳动密集型的并且依赖于专家，对可扩展性和可重复性提出了挑战。我们提出了 TSAssistant，这是一种人机交互的多代理框架，它将 TSA 报告生成分解为专门子代理的工作流程：每个子代理都基于并引用单个 TSA 域，而综合子代理则整合跨域的发现。子代理通过标准化工具界面从精选的生物医学来源中检索和合成证据，并生成单独可引用的、基于证据的部分，其行为由分层指令架构形成，该架构将协调逻辑与领域专业知识和用户意图分开。为了补充这些软约束，编程执行挂钩和持久内存存储在整个工作流程中强制实施硬约束，而交互式细化循环允许专家审查和修改各个部分，并在迭代中保留完整的对话上下文。我们不是进行单一的整体比较，而是将报告质量分解为再现性、证据基础、任务级准确性和专家监督下的可控性，发现高再现性和基础、与人类参考的基本一致以及净积极的专家驱动的改进。