论文

DCFold:单次正向传递的高效蛋白质结构生成

DCFold: Efficient Protein Structure Generation with Single Forward Pass

模型推理推理加速

摘要

AlphaFold3 引入了基于扩散的架构,将蛋白质结构预测提升到全原子分辨率,并提高了准确性。这种最先进的性能使 AlphaFold3 成为各种生成和设计任务的基础模型。然而,其迭代设计大大增加了推理时间,限制了虚拟筛选和蛋白质设计等下游设置的实际部署。我们提出了 DCFold,这是一种单步生成模型,可达到 AlphaFold3 级别的精度。我们的双重一致性训练框架采用了新颖的时间测地线匹配 (TGM) 调度程序,使 DCFold 能够在保持预测保真度的同时实现 15 倍的推理加速。我们在结构预测和粘合剂设计基准方面验证了其有效性。