论文
探测、融合和可信度:多模态癌症分析基础模型表示的系统评估
Probing, Fusion, and Trustworthiness: A Systematic Evaluation of Foundation Model Representations for Multimodal Cancer Analysis
摘要
基础模型(FM)已经成为医疗数据强大的表示提取器,但它们对分布变化下数据集的泛化性仍有待探索。这项工作系统地评估了两个现实世界商业队列(IH-BC 和 IH-NSCLC)的一套计算病理学任务的基于 FM 的表示,这些任务取自许可的内部 (IH) 肿瘤学数据集。该分析重点关注从 IH 多模态数据中提取的两种模式:全玻片图像和转录组图谱。我们首先在八个下游分类任务上对五个 FM 的单峰探测性能进行基准测试,并发现图像和组学表示携带互补的预测信号。然后,我们通过比较基于配对表示的三种图像组学融合策略,研究多模态融合是否可以比单模态基线产生额外的收益。通过共形预测进一步评估所选单模态和多模态管道的可信度。我们的结果表明,FM 表示在分布外数据上实现了具有竞争力的性能,并且当没有单一模态主导信号时,多模态融合主要有帮助。保形预测表明,在大多数点预测失败的情况下,真实的诊断仍然可以在预测集中恢复,从而增强了不确定性感知推理对于临床支持的价值。