SCTA：从单细胞 RNA 测序中发现稳定且可解释的靶基因的代理框架

从单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 数据中识别治疗靶基因仍然是转化生物学中的一个基本挑战。与批量检测不同，scRNA-seq 捕获异质细胞状态和稀有亚群，但这种异质性使得靶点发现对整个流程中的分析选择高度敏感，包括预处理、细胞群选择、差异表达分析和下游生物学解释。因此，现有的工作流程和通用分析代理经常产生不稳定或难以解释的目标假设，限制了它们针对疾病的发现的可靠性。我们提出了 SCTA（单细胞目标代理），这是一种以决策为中心的代理框架，用于从 scRNA-seq 数据中发现稳定且可解释的目标基因。 SCTA 没有将分析视为单一的通用推理任务，而是将目标发现分解为与单细胞管道中关键决策点对齐的专门代理，并用结构化生物证据约束下游推理。在一项关于遗传性慢性胰腺炎的代表性消融研究中，我们证明 SCTA 的完整证据整合在测试配置中的独立运行中产生了最稳定的目标选择，同时恢复了先前研究中验证的生物学一致性、疾病相关机制。这些结果表明，针对单细胞分析结构定制的决策感知代理编排可以提高精准医学中靶点发现的稳健性、可解释性和实用性。