论文
使用 LLM 进行神经电路功能推理
Neural Circuit Function Inference with LLMs
摘要
连接组图谱的成功现在将理解神经系统的挑战转移到了神经回路的解释上。在这里,我们设计了一种新的自动化方法,LLantia(LLM 自动神经回路推理和分析),来系统地推断神经回路功能及其组成神经细胞类型的作用。我们的方法从文献中提取细胞类型功能的描述,并结合连接组,推断所有其他细胞类型的功能,作为后续神经回路功能推断的基础。结果是分层结构的,不同的可能的电路功能在多种可能的行为和生理背景下组织,每个电路功能由子电路描述和相关细胞类型组成,以方便回溯到已知的、已发布的信息并支持进一步的实验研究。我们通过推断成年果蝇大脑所有细胞类型和其中选择的更广泛电路的细胞类型功能来说明我们的方法,并验证我们的发现,包括与我们的分析发布日期后发表的文献进行交叉检查。