论文
HemaHier:用于谱系感知骨髓细胞学的链条件序数层次结构
HemaHier: Chain-Conditioned Ordinal Hierarchies for Lineage-Aware Bone-Marrow Cytology
摘要
骨髓细胞学具有固有的结构:每个细胞都属于造血谱系,并且许多细胞类型处于有序的成熟轨迹上。标准的平面分类器忽略这种结构,将轻微的同谱混乱与严重的跨谱系错误视为相同,并仅预测离散标签。我们提出了 HemaHier,一种用于冷冻或轻度适应的细胞学基础模型的序数分层预测头。它的核心组成部分是链条件成熟度评分,它在每条链查询下读取单个成熟度值,仅在生物学上有效的健康链上进行监督,而发育异常和链外细胞类型仍然是类别,但被排除在成熟度监督之外。精细和谱系预测通过保证层次一致性的共享后验耦合,阶段性目标首先稳定识别,然后添加谱系和成熟度监督。在共享本体下的三个骨髓数据集上,HemaHier 实现了竞争性识别,同时减少了生物学上的严重错误,并添加了扁平分类器所缺乏的谱系内成熟度排序。代码可在 https://github.com/xmindflow/HemaHier 获取。