论文

HERMES:根据临床记录进行对比感知知识图推理以预测患者结果

HERMES: Contrast-Aware Knowledge Graph Reasoning from Clinical Notes for Patient Outcome Prediction

上下文与知识知识图谱

摘要

临床预测模型通常依赖于结构化电子健康记录数据,例如时间序列和程序代码。虽然最近的方法已经开始利用非结构化的临床记录,但它们通常将其编码为平面序列,这可能会丢失临床叙述中存在的明确的关系和时间结构。作为回应,我们提出了 HERMES,这是一个基于图形的框架,专门对临床文本进行操作,同时保留临床关系。这种方法建立在两个关键思想之上。首先,个性化知识图(KG)是通过大语言模型引导的临床记录提取和对比逻辑建模来构建的,可以明确地捕获时间动态和治疗失败以及结果的变化。其次,图注意力网络通过 KG 上基于图的学​​习来合成患者表征。 MIMIC-III 和 MIMIC-IV 的院内死亡率和 30 天再入院预测实验表明,HERMES 始终优于强大的纯文本基线。我们的研究结果表明,使用对比逻辑建模的显式关系建模可以显着提高预测性能。