论文

临床意图提取:FHIR 对齐表示和 CIRCA 基准

Clinical Intent Extraction: A FHIR-Aligned Representation and the CIRCA Benchmark

模型评测基准与评测资源

摘要

如今,未来的临床行动、后续行动、命令、转诊和指示决定了患者接下来会发生什么,这些都在不兼容的语料库中以细小的片段进行注释:每个片段都记录了一个文本范围和一个粗略类别。我们引入了临床意图提取 (CIE),将这些操作恢复为完整的结构化记录的任务,以及临床意图表示 (CIR),它将每个操作分解为其动词、类型、编码目标、时间和条件,并添加先前数据集不共同表示的两个轴:请求意图、操作背后的权威(建议、计划、命令或选项,与 HL7 FHIR 一致)以及模态(七值)临床实力规模。在 CIR 中重新表达五个异构语料库(CLIP、MedDec、ap_parsing、PaniniQA、SIMORD)会产生 CIRCA:跨越两个音符分布的 10,011 个协调意图,具有经过人工验证的子集、源到 CIR 交叉路口和确定性 FHIR R4 映射器。 CIRCA 由三模型共识构建,自动接受高度一致的意图,并将其余的路由到人工审核;经审计的协议层与人类决策的匹配率为 88.4%。对没有特定任务训练的五个现有模型进行基准测试,暴露了 CIRCA 目标的差距:给定跨度,它们很好地标记了类型(85% 到 91%),但只有 18% 到 35% 的时间正确地获得所有四个封闭字段。所有工件均已发布,并在 PhysioNet 凭证访问下将 MIMIC 衍生层共享为独立注释。