HCOE：把生物医学语言嵌入映射到临床本体层级

生物医学语言模型 (LM) 编码文本语义，但不明确保留医学代码层次结构。我们提出了双曲临床本体嵌入（HCOE），用于层次感知的临床概念表示。 HCOE 将冻结的 BioBERT 嵌入映射到庞加莱球中，将父端和子端本体引导的对比学习与从粗到细的本体路径聚合相结合。它使用由临床分类软件 (CCS) 和解剖治疗化学 (ATC) 药物层次结构组织的国际疾病分类 (ICD) 代码。评估表明，HCOE 在 ICD/ATC 临床关系预测和 CCS 到 PheCode 层次结构转换方面表现最佳。在 MIMIC-IV 数据集上，HCOE 在死亡率预测、再入院预测、药物推荐和稀有药物预测方面也取得了最佳性能。