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MEMIG:以定量结构化记忆支持抗体优化Agent

MEMIG: Self-evolving Memory Construction for Antibody Optimization

上下文与知识应用与实践知识图谱记忆科学研究Agent记忆Context Graph

摘要

记忆已成为自演进LLM Agent的重要组成:保存并检索过去rollout的经验,用于指导未来决策。现有系统常将经验写成自由自然语言,并通过重写维护,适合经验能够被叙述的任务。然而在科学发现和优化中,经验往往是在特定条件下由oracle测得的数值。将其重写为文本,会丢失记录的明确索引位置,以描述替代测量,也无法表达多个干预的相互作用。我们认为,生物分子优化Agent的记忆应当可索引、定量且结构化,并提出实现这三项性质的MEMIG记忆构建框架。MEMIG为每条见解使用领域标识,累计属性oracle测得的定量效应,使更新局限于局部、检索成为精确查找。随后,它将同时施加的干预所对应的见解连接起来,并通过分解每个已评价的干预集合,测量其上位性相互作用。结果显示,在计算模拟的抗体优化任务中,MEMIG在多数设置下改善表现。

MEMIG:以定量结构化记忆支持抗体优化Agent:论文配图
图1:MemIG概览。MemIG使用以抗体为依据的标识符构建上位性图。有向边组织“属性→种系→区域→突变”的层级,无向边连接共同出现的突变,并存储其上位性效应。